Stefano Molardi nació en Cremona (Italia) en 1970. Es organista, clavecinista, director de orquesta y musicólogo. Se graduó en órgano y clave, y obtuvo además la licenciatura en Musicología en la Universidad de Cremona con la máxima calificación, presentando una tesis sobre La Nativité du Seigneur de Olivier Messiaen. Completó su formación con destacadas figuras internacionales como Ewald Kooiman, Christopher Stembridge, Harald Vogel y Luigi Ferdinando Tagliavini, perfeccionándose especialmente con Michael Radulescu en la Hochschule für Musik de Viena entre 1996 y 1999, colaborando además con él como continuista en la Académie Bach de Porrentruy (Suiza).
Galardonado en numerosos concursos nacionales e internacionales de órgano, obtuvo el Primer Premio en el Concurso Internacional de Órgano de Pasian di Prato (Udine) y en el Concurso Nacional “Città di Viterbo”, además de recibir reconocimientos en prestigiosos certámenes como Brujas y el Paul Hofhaimer de Innsbruck.
Como solista, continuista y director, ha desarrollado una intensa carrera internacional actuando en algunos de los auditorios y festivales más importantes de Europa, Estados Unidos, Brasil y Japón, entre ellos el Concertgebouw de Ámsterdam, el Musikverein de Viena, el Teatro La Fenice de Venecia, el Carnegie Hall de Nueva York, el Jordan Hall de Boston, el Walt Disney Concert Hall de Los Ángeles y la Sala São Paulo de Brasil.
Ha sido invitado regularmente a importantes festivales internacionales como Musica e Poesia a San Maurizio de Milán, Wiener Orgelkonzerte, el Festival Internacional de Maastricht, el Festival Monteverdi de Cremona, los festivales de Arnstadt y Núremberg, así como ciclos y conciertos en París, Londres, Viena, Bilbao, Nantes, Innsbruck, Montpellier, Estambul, Tokio y otras ciudades europeas y americanas.
Entre 2005 y 2013 dirigió el conjunto barroco I Virtuosi delle Muse, con el que obtuvo un notable reconocimiento internacional. Como director ha interpretado obras como Ademira de Lucchesi, Mitridate de Porpora, Farnace y Giustino de Vivaldi, así como la Pasión según San Mateo y la Pasión según San Juan de J. S. Bach. También es cofundador y director de la Italian Baroque Academy (IBA), especializada en interpretación historicista.
En el ámbito discográfico ha grabado para sellos como Brilliant Classics, Divox, Tactus, Christophorus y Deutsche Grammophon, además de colaborar con SWR, Radio France, Radio Suisse Romande y MEZZO. Sus grabaciones han recibido importantes reconocimientos de la crítica internacional, incluyendo los “5 Diapason” de la revista francesa Diapason y las “5 estrellas Goldberg”.
Entre sus proyectos más destacados figura la grabación integral de la obra para órgano de Johann Sebastian Bach para Brilliant Classics, publicada en quince CD, así como integrales dedicadas a Johann Kuhnau, la familia Bach y Giovanni Benedetto Platti. En los últimos años ha continuado ampliando su discografía con nuevas grabaciones dedicadas al repertorio barroco italiano y alemán. Desde 2018 mantiene además una estrecha colaboración artística con el violinista Gian Andrea Guerra en el proyecto Duo Seraphim.
Actualmente es profesor de órgano y música antigua en la Scuola Universitaria di Musica della Svizzera italiana de Lugano y desarrolla asimismo una intensa actividad pedagógica mediante clases magistrales y conferencias en Europa, Estados Unidos y Japón.