Estudió órgano, piano y fortepiano en el Conservatorio de Perugia con W. Van de Pol, M. F. Spaventi y C. Veneri, respectivamente, y clave en la Scuola di Musica di Fiesole con A. Fedi. Continuó sus estudios de órgano en el Conservatorio de Ámsterdam con J. Van Oortmerssen, obteniendo en 1999 el título de posgrado en música barroca.
En 1995 fue nombrado organista titular de la Colegiata de Santa Maria Maggiore de Collescipoli, donde interpreta el órgano barroco W. Hermans (1678). Desarrolla regularmente una intensa actividad concertística y pedagógica mediante conciertos y clases magistrales en Italia, Europa, Estados Unidos, Canadá y Japón, siendo invitado habitual de algunos de los festivales de música antigua más prestigiosos, como el Lufthansa Festival, Oude Muziek de Utrecht, Vantaa Baroque Festival, el Festival Internacional de Música Barroca de California y diversos ciclos y universidades de Estados Unidos, Reino Unido y España.
Ha ofrecido conciertos y grabaciones en directo para importantes emisoras europeas como BBC, ZDF, YLE y RAI. Sus interpretaciones de música antigua y barroca han recibido un amplio reconocimiento internacional por parte de la crítica especializada.
Fabio Ciofini desarrolla además una destacada actividad como director y concertista. Ha grabado para los sellos Bottega Discantica de Milán, Loft Recordings de Seattle, Brilliant Classics de Ámsterdam y Glossa de Madrid. Es director de la Academia Hermans, donde ha colaborado con destacados intérpretes como el violinista Enrico Gatti, la soprano Roberta Invernizzi y el fortepianista Bart Van Oort, con quien grabó los conciertos KV 466 y 467 de Mozart para piano y orquesta, considerados “excepcionales” por la crítica especializada.
Su grabación de la Opus 4 de Corelli junto al Ensemble Aurora recibió importantes reconocimientos internacionales como el Diapason d’Or y el Deutschen Schallplattenkritik.
Actualmente es profesor de teclado histórico en el Istituto Superiore di Studi Musicali “G. Briccialdi” de Terni y, desde 2010, director artístico de la Fondazione Brunello e Federica Cucinelli de Solomeo (Perugia).